盐城市妇幼保健院新生儿科成立于1989年，是江苏省临床重点专科（联合儿内科共同申报），江苏省首批七家省级新生儿危急重症救治中心之一，盐城市市级新生儿危急重症救治中心。

2001年，在全市率先成立新生儿科；2006年，成立全市首家新生儿无陪病房（NICU）；2013年、2017年被评为“江苏省妇幼健康重点学科”；2021年，成立全市首家新生儿家庭化病房。

江苏省新生儿专业质量控制中心委员单位、盐城市新生儿专业质控中心挂靠单位。

现有新生儿专科医师14名，扬州大学儿科学专业硕士生导师1名，主任医师2名，副主任医师4名，博士1名，硕士6名。

科室设备齐全，包括有创呼吸机、双水平无创呼吸机、多功能培养箱、血气分析仪、NO吸入治疗仪、进口转运系统、振幅整合脑功能监护仪、进口床旁摄片机、床旁彩超以及多功能吊塔等。

省级临床重点专科要求的临床诊疗项目常规开展，诊治呼吸、感染、消化、心血管、泌尿、神经、内分泌、遗传代谢等系统各种疾病，以及极低、超低出生体重儿的综合管理，疗效满意。2022年在全市率先开展NO吸入治疗新生儿持续肺动脉高压，同时与小儿外科紧密协作开展多种新生儿外科手术。为本专业成为盐城地区高水平新生儿内科诊疗中心奠定了坚实的基础。

积极开展新生儿相关临床研究。近年来获得江苏省第五期“333工程”科研资助项目、江苏省妇幼保健协会科研项目、盐城市医学科技发展项目多项。获江苏省卫计委医学新技术引进奖、江苏省妇幼保健新技术引进奖、淮海科学技术奖以及盐城市医学新技术引进奖10余项。发表SCI论文及《中华实用儿科临床杂志》、《中华围产医学杂志》、《中华新生儿科杂志》等核心期刊文章20余篇。